HMMμ Markov chainμ κΈ°μ΄νλ€. Markov chainμ μ΄λ€ μ§ν©μμ κ°μ μ·¨ν μ μλ μμμ λ³μ, μν μνμ€μ νλ₯ μ λν΄ μλ €μ£Όλ λͺ¨λΈμ΄λ€. μ΄λ¬ν μ§ν©μ λ¨μ΄, νκ·Έ, λλ λ μ¨μ κ°μ μ΄λ€ κ²μ λνλΌμ μλ κΈ°νΈμ΄λ€. Markov chainμ λ§μ½ μ°λ¦¬κ° κ·Έ μμμμ λ―Έλλ₯Ό μμΈ‘νκ³ μΆλ€λ©΄ μ€μν κ²μ νμ¬ μνλΏμ΄λΌλ κ²μ κ°μ‘°νλ€. νμ¬ μν μ΄μ μ μνλ νμ¬ μνλ₯Ό ν΅νμ§ μλ ν λ―Έλμ μν₯μ λ―ΈμΉμ§ μλλ€.[1] λ€λ₯Έ λ§λ‘ νννλ©΄, κ³Όκ±°μ νμ¬ μν λͺ¨λλ₯Ό κ³ λ €νμ λ λ―Έλ μνκ° λνλ νλ₯ κ³Ό νμ¬ μνλ§μ κ³ λ €νμ λ λ―Έλ μνκ° λ°μν νλ₯ μ΄ λμΌνλ€λ κ²μ΄λ€. μμ±μ νΈλ₯Ό Markov Modelμ μνμ¬ λ°μνμλ€κ³ κ°μ νκ³ νμ΅λ¨κ³μμ λͺ¨λΈμ νλΌλ―Έν°λ₯Ό μΆμ ν λ€μ μΈμκΈ°μμλ μΆμ λ νλΌλ―Έν°λ₯Ό μ΄μ©νμ¬ λ―Έμ§μ μ λ ₯ μμ±μ κ°μ₯ μ ν©ν λͺ¨λΈμ μ°ΎμλΈλ€. μΈμμ μ¬μ©λλ λͺ¨λΈμ μμ λλ λ¨μ΄ μμ²΄κ° λ μ μλ€. λ§λ₯΄μ½ν λͺ¨λΈμ 맀 μκ° λ§λ€ μνλ₯Ό λ°κΎΈλ μ νμνκΈ°κ³(finite state machine)μ΄λ€. μ΄λ€ μκ° tμ μν jμ λ€μ΄κ° λ μμ± λ°±ν° otκ° λ°μλλ€. μν iμμ μν jλ‘ μ²μ΄ν νλ₯ μ aijλ‘ μ£Όμ΄μ§λ€. λͺ¨λΈ Mμμ μνμ΄ Xλ₯Ό λ°λΌμ κ΄μΈ‘μ΄ Oκ° λ°μν νλ₯ μ μ²μ΄νλ₯ κ³Ό κ΄μΈ‘νλ₯ μ κ³±μΌλ‘ ννλλ€. μλ₯Ό λ€μ΄ κ΄μΈ‘μ΄ O=o1..o6κ° μνμ΄ X=1,2,2,3,4,4,5,6μ λ°λΌμ λ°μνλ νλ₯ μ λ€μκ³Ό κ°λ€.